Numéro 1 de l’Ambassade, l’Ambassadeur des Comores à Rabat est la haute autorité de la Mission Diplomatique de l’Union des Comores au Royaume du Maroc. Il est chargé, sous l’autorité du Ministre des Affaires Etrangères, de la mise en œuvre de la politique extérieure de l’Union des Comores. Il représente au Royaume du Maroc le Président de l’Union des Comores, le Gouvernement et chacun des Ministres. Dans l’exercice de ses fonctions, l’Ambassadeur informe le Gouvernement comorien, négocie au nom de l’Etat, veille au développement des relations de l’Union des Comores avec le Royaume du Maroc, assure la protection des intérêts de l’Etat comorien et celle des ressortissants comoriens résidents au Maroc.
En sa qualité d’autorité supérieure de la Chancellerie de l’Ambassade de l’Union des Comores à Rabat, et avec l’assistance technique des Diplomates de la Chancellerie, notamment du Ministre Conseiller qui le remplace en son absence, l’Ambassadeur des Comores à Rabat, Chef de Mission Diplomatique, supervise et coordonne les activités de la Mission Diplomatique (diplomatiques, économiques, culturelles, consulaires) ainsi que l’ensemble des Services y compris ceux du Consulat Général à Laayoune.